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　　中科院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心/植物生理生態(tài)研究所和上海師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院黃學(xué)輝團(tuán)隊合作，首次繪制了栽培稻—野生稻的泛基因組圖譜，并系統(tǒng)鑒定了涵蓋各類群水稻的編碼基因集。1月16日，這一成果以長文形式在線發(fā)表于《自然—遺傳學(xué)》雜志。
　　從野生稻馴化而來的水稻品種眾多、分布廣泛，除了全亞洲，在歐洲、美洲和澳洲也有很少量分布。水稻可以適應(yīng)多樣的生態(tài)環(huán)境和農(nóng)藝條件，其豐富的遺傳多樣性在馴化和現(xiàn)代育種中都發(fā)揮了重要作用，并將成為應(yīng)對糧食需求增長和環(huán)境變化，進(jìn)行品種改良的關(guān)鍵資源。
　　據(jù)了解，20多年來，粳稻“日本晴”一直是水稻研究的模式材料。在之前的研究中，水稻基因組的遺傳變異鑒定大多依賴于其序列與粳稻“日本晴”的相似性。然而，粳稻“日本晴”不能涵蓋栽培稻和普通野生稻中所有的功能基因。比如，耐水淹基因、高效吸收磷肥基因等在“日本晴”等水稻品種中完全缺失。
　　黃學(xué)輝告訴《中國科學(xué)報》記者，研究團(tuán)隊選取了66個來自不同水稻類群的栽培稻品種和野生稻株系，對它們進(jìn)行深度測序、從頭序列組裝和基因注釋分析，獲得了水稻各類群材料的精細(xì)基因組圖譜，鑒定出了水稻基因組中各類復(fù)雜的遺傳變異，并且發(fā)現(xiàn)很多功能基因存在多種等位基因類型。此外，新鑒定的很多編碼基因存在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物和蛋白質(zhì)功能結(jié)構(gòu)域，暗示可能存在一定的生物學(xué)功能。
　　相關(guān)專家表示，此項成果將有助于精確發(fā)掘復(fù)雜農(nóng)藝性狀的關(guān)鍵變異位點，有力推動水稻的功能基因組學(xué)研究，有助于育種家充分利用各類群水稻中豐富的遺傳變異，為進(jìn)一步提升我國水稻的產(chǎn)量潛力、抗逆特點等提供了重要的基礎(chǔ)信息。
　?。ㄔd于《中國科學(xué)報》 2018-01-17 第1版 要聞)