——習(xí)近平總書記在致中國(guó)科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求
——中國(guó)科學(xué)院辦院方針
語(yǔ)音播報(bào)
犬種表型的多樣性以及犬和人類相關(guān)的遺傳疾病風(fēng)險(xiǎn),使犬類成為研究復(fù)雜性狀遺傳基礎(chǔ)和人類生物醫(yī)學(xué)模型的理想對(duì)象。國(guó)際合作項(xiàng)目Dog10K旨在揭示犬類的表型多樣性、疾病、行為和馴化歷史的遺傳基礎(chǔ)。為了更好地展示與利用這些數(shù)據(jù),中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所王國(guó)棟學(xué)科組等建立了綜合性犬類多組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)——Dog10K數(shù)據(jù)庫(kù)。
Dog10K數(shù)據(jù)庫(kù)整合了1,987只犬類基因組的單核苷酸變異、43個(gè)犬種的新發(fā)突變、105,057個(gè)海馬的單核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、74,067個(gè)白細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)以及30個(gè)在已發(fā)表犬科研究中獲取的不同年齡的血液轉(zhuǎn)錄組樣本。該數(shù)據(jù)庫(kù)提供了可視化、統(tǒng)計(jì)分析、瀏覽、搜索和下載等功能。同時(shí),該數(shù)據(jù)庫(kù)整合了3種分析工具即Selscan、LiftOver和AgeConversion,以幫助研究人員定制化地分析組學(xué)數(shù)據(jù)。
Dog10K數(shù)據(jù)庫(kù)將為分析、展示和利用犬類多組學(xué)數(shù)據(jù)提供基礎(chǔ)性平臺(tái),有助于推動(dòng)復(fù)雜性狀及遺傳疾病相關(guān)研究,促進(jìn)學(xué)術(shù)合作與研究成果共享。
近日,相關(guān)研究成果以Dog10K: An integrated Dog10K database summarizing canine multi-omics為題,發(fā)表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金、科技創(chuàng)新2030-“腦科學(xué)與類腦研究”重大項(xiàng)目、昆明市“春城計(jì)劃”等的支持。
數(shù)據(jù)庫(kù)概覽
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