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環(huán)狀RNA（circRNA）是一類(lèi)單鏈、閉合環(huán)狀的RNA分子，由mRNA前體通過(guò)反向剪切環(huán)化產(chǎn)生。相較于常規(guī)的線性RNA，circRNA有著獨(dú)特的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，其不具備5'端帽和3'端poly(A)尾結(jié)構(gòu)，也不存在游離末端，因此不易被核酸外切酶降解，從而比線性RNA更加穩(wěn)定。circRNA能夠與親本DNA、miRNA、mRNA或蛋白質(zhì)結(jié)合，進(jìn)而調(diào)控基因的表達(dá)（非編碼功能）。最新研究發(fā)現(xiàn)，circRNA還擁有編碼功能，其編碼的肽類(lèi)或蛋白在細(xì)胞增殖、分化和凋亡等生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著重要調(diào)控作用。憑借其結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性、較低的免疫原性和蛋白翻譯功能，circRNA正逐步被開(kāi)發(fā)成為新一代的基因表達(dá)調(diào)控平臺(tái)，有望革新傳統(tǒng)mRNA藥物的設(shè)計(jì)范式。研究表明，在衰老過(guò)程中，circRNA會(huì)在諸如心臟、腦等一些重要器官里逐漸累積，密切調(diào)控衰老。然而，目前人們對(duì)circRNA調(diào)控衰老的認(rèn)知僅局限于少數(shù)幾個(gè)circRNA，大部分circRNA對(duì)衰老的作用和機(jī)制仍不清楚。為全面解析circRNA的時(shí)空表達(dá)特征與功能圖譜，中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所研究員何永捍團(tuán)隊(duì)聯(lián)合研究所生物多樣性大數(shù)據(jù)中心，構(gòu)建了首個(gè)跨物種、跨組織的衰老相關(guān)circRNA數(shù)據(jù)庫(kù)——CircAge。CircAge整合了來(lái)自GEO、GSA等公共數(shù)據(jù)庫(kù)以及實(shí)驗(yàn)室自主測(cè)定的共計(jì)803個(gè)RNA-seq數(shù)據(jù)集，涵蓋了人、獼猴、大鼠、小鼠、斑馬魚(yú)、果蠅和線蟲(chóng)7個(gè)物種、24種組織類(lèi)型的不同年齡段樣本，最終成功鑒定到53萬(wàn)個(gè)circRNA，其中大約23%的circRNA在不同物種間展現(xiàn)出保守性。經(jīng)分析發(fā)現(xiàn)，circRNA在多個(gè)組織中會(huì)隨衰老進(jìn)程出現(xiàn)累積趨勢(shì)。該數(shù)據(jù)庫(kù)還整合了miRanda、TargetScan、CPAT、IRESfinder及POSTAR3等分析工具，實(shí)現(xiàn)了對(duì)circRNA與miRNA、RNA結(jié)合蛋白（RBP）互作、circRNA編碼潛能等多維度的功能預(yù)測(cè)。作為國(guó)際上首個(gè)衰老相關(guān)的circRNA數(shù)據(jù)庫(kù)，CircAge有望為衰老生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)、干預(yù)靶點(diǎn)的篩選以及circRNA治療策略的開(kāi)發(fā)提供關(guān)鍵技術(shù)支撐。5月12日，相關(guān)研究成果以CircAge: A Comprehensive Resource for Aging-Associated Circular RNAs Across Species and Tissues為題，發(fā)表于Genomics,?Proteomics & Bioinformatics。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、云南省基礎(chǔ)研究計(jì)劃和云南省“興滇英才”項(xiàng)目等的支持。論文鏈接數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接跨物種衰老相關(guān)circRNA的鑒定和CircAge數(shù)據(jù)庫(kù)功能概覽