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加快打造原始創(chuàng)新策源地,加快突破關(guān)鍵核心技術(shù),努力搶占科技制高點(diǎn),為把我國(guó)建設(shè)成為世界科技強(qiáng)國(guó)作出新的更大的貢獻(xiàn)。

——習(xí)近平總書(shū)記在致中國(guó)科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)、面向國(guó)家重大需求、面向人民生命健康,率先實(shí)現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展,率先建成國(guó)家創(chuàng)新人才高地,率先建成國(guó)家高水平科技智庫(kù),率先建設(shè)國(guó)際一流科研機(jī)構(gòu)。

——中國(guó)科學(xué)院辦院方針

首頁(yè) > 科研進(jìn)展

腫瘤生物信息學(xué)研究獲進(jìn)展

2025-05-22 計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心
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語(yǔ)音播報(bào)

近日,中國(guó)科學(xué)院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心科研人員借助“東方”超級(jí)計(jì)算系統(tǒng),提出了基于Transformer的乳腺癌病理圖像HRD預(yù)測(cè)方法——SuRe-Transformer。

該方法解決了將Transformer應(yīng)用于病理圖像分析時(shí)存在的三個(gè)問(wèn)題。一是通過(guò)徑向衰減稀疏自注意力增強(qiáng)關(guān)鍵區(qū)域Patch的多樣性選擇;二是使用簇大小加權(quán)采樣策略提升特征區(qū)域的代表性捕獲能力;三是引入無(wú)監(jiān)督對(duì)比學(xué)習(xí)方法優(yōu)化病理圖像特征嵌入質(zhì)量。實(shí)驗(yàn)表明,SuRe-Transformer在多個(gè)獨(dú)立測(cè)試集上的HRD預(yù)測(cè)性能優(yōu)于現(xiàn)有主流方法。SuRe-Transformer具有很強(qiáng)的通用性,在TP53PIK3CAMAP3K1等多個(gè)基因突變預(yù)測(cè)任務(wù)中AUC均超過(guò)0.844。

相關(guān)研究成果被《npj-腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療》(npj Precision Oncology錄用。研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金和中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)(B類)的支持。

SuRe-Transformer架構(gòu)圖

打印 責(zé)任編輯:侯茜

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