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加快打造原始創(chuàng)新策源地,加快突破關(guān)鍵核心技術(shù),努力搶占科技制高點(diǎn),為把我國(guó)建設(shè)成為世界科技強(qiáng)國(guó)作出新的更大的貢獻(xiàn)。

——習(xí)近平總書(shū)記在致中國(guó)科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)、面向國(guó)家重大需求、面向人民生命健康,率先實(shí)現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展,率先建成國(guó)家創(chuàng)新人才高地,率先建成國(guó)家高水平科技智庫(kù),率先建設(shè)國(guó)際一流科研機(jī)構(gòu)。

——中國(guó)科學(xué)院辦院方針

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【中國(guó)科學(xué)報(bào)】犬科動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)iDog正式上線

2018-11-12 中國(guó)科學(xué)報(bào) 沈春蕾 張湘泉
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語(yǔ)音播報(bào)

  近日,由中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物所與北京基因組所合作開(kāi)發(fā)的犬科動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)iDog正式上線。該項(xiàng)研究成果在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》在線發(fā)表。中科院昆明動(dòng)物研究所研究員王國(guó)棟和北京基因組研究所正高級(jí)工程師趙文明為共同通訊作者。

  家犬毫無(wú)爭(zhēng)議是人類最好的朋友之一,同時(shí)也是許多人類遺傳病的基礎(chǔ)研究模型。王國(guó)棟介紹,iDog 是第一個(gè)家犬與野生犬科動(dòng)物整合性資源數(shù)據(jù)庫(kù),它不僅提供了豐富的組學(xué)數(shù)據(jù)、基因組拼接數(shù)據(jù)、基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)、犬類疾病及相關(guān)表型信息,還整合了序列比對(duì)工具用于線上數(shù)據(jù)分析,以及基因組瀏覽器用于數(shù)據(jù)可視化。iDog的建立不僅有利于全球范圍內(nèi)犬科動(dòng)物的研究,還為大量的愛(ài)狗人士提供了一個(gè)用戶友好的界面查找相關(guān)寵物狗信息。

  據(jù)悉,iDog具有良好的可拓展性和持續(xù)性等特點(diǎn),其包含的主要模塊有基于127個(gè)家犬樣本基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)生的變異信息數(shù)據(jù)庫(kù)、含有32220個(gè)基因的犬科動(dòng)物基因數(shù)據(jù)庫(kù)、基于RNA-Seq測(cè)序數(shù)據(jù)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)、犬科動(dòng)物相關(guān)疾病的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)、人—狗疾病同源信息數(shù)據(jù)庫(kù)、犬科動(dòng)物基因組拼接數(shù)據(jù)庫(kù)等。iDog計(jì)劃后續(xù)整合更多的組學(xué)數(shù)據(jù),在Dog10K項(xiàng)目的背景下,持續(xù)更新高質(zhì)量的數(shù)據(jù)集,逐步轉(zhuǎn)化成犬科動(dòng)物基礎(chǔ)研究的信息知識(shí)寶庫(kù)。

 ?。ㄔd于《中國(guó)科學(xué)報(bào)》 2018-11-12 第5版 創(chuàng)新周刊)

打印 責(zé)任編輯:侯茜

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